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Reference: BIOPOLIS2025-47
Position: Junior Researcher (PhD holder)
Main research field: Epidemiology
Type of contract: non-fixed (12 months), eventually renewable


1. Association BIOPOLIS is opening a call for one (1) Research Contract to a Junior Researcher (Reference BIOPOLIS 2025-47), in the framework of the project Science4TBControl "Improving the efficacy of animal tuberculosis eradication programs at the wildlife-livestock interface through a multidisciplinary science-based approach” (16615/MPr-2023-12-SACCCT-IC&DT). Science4TBControl is a project funded by FCT that aims to improve the efficacy of bovine tuberculosis eradication programs by developing and testing innovative science-based approaches and tools at the interplay between the disciplines of epidemiology and ecology.


2. Admission requirements
Applications are open to candidates of any nationality holding a doctoral (PhD) degree in Veterinary Sciences, Biological Sciences or equivalent areas by the me the contract starts. Authorization to work in Portugal is required.


3. Skills and competences
The following skills and competences are required and will be considered in the evaluation process:
i)Proven experience in molecular diagnostics (DNA extraction, PCR amplification, and sequencing techniques) of emerging infectious diseases of wildlife. Prior experience working with non-
invasive samples will be valued;
ii)Strong knowledge of wildlife disease ecology and wildlife integrated monitoring, including health surveillance and population monitoring. Prior experience with photo trapping of Iberian fauna will be valued;
iii)Experience with Bayesian statistical methods in epidemiology;
iv)Experience working in bacteriology at a Biosecurity Level 3 (BSL3) laboratory;
v)Experience in publishing papers in indexed international peer-reviewed scientific journals;
vi)Fluency in English. Fluency in Spanish and Portuguese will be valued;
vii)Good oral and writing communication skills;
viii)Able to work well within a team.
The candidate should have strong troubleshooting and problem-solving skills.
In case the degree was awarded by a non-Portuguese higher education institution it must comply with the provisions of Decreto-Lei n.º 66/2018, de 16 de Agosto, as currently in force (amended by Decree-Law No. 86/2023) and all formalities established therein must be complied with at the signature of work contract.


4. Work plan 
The successful candidate will perform field sampling, camera trapping and laboratory work for the detection and isolation of Mycobacterium tuberculosis complex (MTC), and Bayesian data analysis to ties mate epidemiological parameters. Specific responsibilities will involve tasks outlined in Science4TBControl Tasks 1-5, including:
a. Performing fieldwork to collect biological samples from harvested wild ungulates at study sites in Portugal and Spain;
b. Performing camera trapping fieldwork at study sites in Portugal and Spain;
c. Processing and analysing camera-trapping data to es mate the abundance of domes c and wild hosts;
d. Performing bacteriological culture for the isolation of MTC in a BSL3 laboratory
e. Performing conventional and real- me PCR for MTC nucleic acids;
f. Conducting epidemiological analyses, employing Bayesian methods;
f. Engaging with stakeholders to facilitate knowledge exchange and application;
g. Collaboration in writing technical reports and scientific publications. The work will be developed under the scientific supervision of Nuno Santos (Principal Investigator), and Gonçalo Curveira Santos (project researcher).


5. Monthly remuneration 
Monthly spend is € 2.351,53 (Level 33) according to the s pends established by FCT, I.P. in Portugal. Payment will be made by bank transfer every month. The successful candidate will also be entitled to accident insurance. Applicable legislation: Labour Code, approved by Law No. 7/2009, of 12 February, as currently in force (including amendments up to 2025).


6. Workplace
The work will primarily be done at CIBIO – Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, located at Rua Padre Armando Quintas nº7, 4485-661 Vairão, Portugal, with periods of fieldwork at study sites in Portugal and Spain. Working periods in partner Research Ins tu ons may take place.


7. Application formalization
The call for applications is open between 24/11/2025 and 12/12/2025.
Applications should be submited to the electronic address https://www.cibio.up.pt/en/jobs/ with the following documents in digital format, preferably in PDF format:
i) Curriculum vitae (Up to four A4 pages);
ii) Certificate of Qualifications;
iii) Proof of residence permit (if applicable);
Expect start date: 1st January 2026


8. Selection criteria
Assessment will be made in accordance with admission requirements (3. Skills and competences) and will be based on:
i)the relevance of previous experience in epidemiology (50%);
ii)the relevance of previous experience in data analysis (20%);
iii) overall quality of the curriculum vitae (30%);
Candidate final classification shall be given based on a scale 0 to 100.
The members of the selection panel may invite the top-ranked candidates for a subsequent interview (in person or by videoconference) to establish the final ranking if the difference between the classification of the top two candidates is less than 10 points. The jury may not award the position if the profile of the candidates does not meet the requirements of this call.


9. Jury composition
Chair: Nuno Santos (Auxiliary Researcher at BIOPOLIS-CIBIO, Chair)
Vowels: Gonçalo Curveira Santos (Researcher at BIOPOLIS-CIBIO, vowel) and Tereza Almeida (Researcher at BIOPOLIS-CIBIO, vowel)
Substitute members: Paulo Célio Alves (Principal Researcher at BIOPOLIS-CIBIO) and João Queirós (Researcher at BIOPOLIS-CIBIO)

10. Results announcement
All candidates will be informed of the outcome of their application by email. After notification, candidates have ten (10) days to submit comments or appeals via hru@biopolis.pt.
Applicants who fail to submit their application correctly or do not meet the required qualifications will be excluded. The jury may request supporting documentation for any statements made in the application. False declarations will be penalized in accordance with the law. Hiring is conditional upon the identification of suitable candidates. If no candidates meet the required profile, the posi on will not be awarded.


11. Policy of Non-Discrimination and Equal Access
Associação BIOPOLIS actively promotes a policy of non-discrimination and equal access, ensuring that no candidate is privileged, benefited, impaired or deprived of any rights, nor exempted from any duties, on the basis of ancestry, age, sex, sexual orientation, marital status, family and economic situation, education, social or economic background, gene c heritage, reduced work capacity, disability, chronic illness, nationality, ethnic origin or race, place of birth, language, religion, political or ideological beliefs, or union membership.In accordance with Law no. 4/2019 of January 10, as currently in force, candidates must declare, under oath in the application form, their degree and type of disability, as well as any specific communication or interaction requirements needed during the selection process.


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Posição: Investigador Júnior (doutorado)
Área principal de investigação: Epidemiologia
Tipo de contrato: não fixo (12 meses), eventualmente renovável

1. Enquadramento
A Associação BIOPOLIS abre concurso para um (1) contrato de Investigador Júnior (Referência BIOPOLIS 2025-47), no âmbito do projeto Science4TBControl – "Improving the efficacy of animal tuberculosis eradication programs at the wildlife-livestock interface through a multidisciplinary science-based approach” (16615/MPr-2023-12-SACCCT-IC&DT). Este projeto, financiado pela FCT, visa melhorar a eficácia dos programas de erradicação da tuberculose bovina através do desenvolvimento e teste de abordagens e ferramentas inovadoras baseadas na ciência, na interface entre epidemiologia e ecologia.

2. Requisitos de admissão
Aberto a candidatos de qualquer nacionalidade, titulares de grau de doutoramento (PhD) em Ciências Veterinárias, Ciências Biológicas ou áreas equivalentes, à data de início do contrato. É necessária autorização para trabalhar em Portugal.

3. Competências
São exigidas as seguintes competências (serão consideradas na avaliação):
i) Experiência comprovada em diagnóstico molecular (extração de DNA, PCR, sequenciação) de doenças infeciosas emergentes em fauna selvagem; experiência com amostras não invasivas será valorizada;
ii) Conhecimento sólido em ecologia de doenças da vida selvagem e monitorização integrada, incluindo vigilância sanitária e monitorização populacional; experiência com fotoarmadilhagem da fauna ibérica será valorizada;
iii) Experiência com métodos estatísticos Bayesianos em epidemiologia;
iv) Experiência em bacteriologia em laboratório de nível de biossegurança 3 (BSL3);
v) Experiência na publicação de artigos em revistas científicas internacionais indexadas;
vi) Fluência em inglês; fluência em espanhol e português será valorizada;
vii) Boas competências de comunicação oral e escrita;
viii) Capacidade de trabalho em equipa.
Caso o grau tenha sido obtido fora de Portugal, deve cumprir as disposições do Decreto-Lei n.º 66/2018, de 16 de agosto, na redação atual (alterado pelo Decreto-Lei n.º 86/2023), e todas as formalidades devem ser cumpridas na assinatura do contrato.


4. Plano de trabalhos
O candidato selecionado realizará amostragem de campo, fotoarmadilhagem e trabalho laboratorial para deteção e isolamento do complexo Mycobacterium tuberculosis (MTC), bem como análise de dados Bayesiana para estimar parâmetros epidemiológicos. As tarefas incluem:
a) Recolha de amostras biológicas de ungulados selvagens abatidos em locais de estudo em Portugal e Espanha;
b) Trabalho de campo com fotoarmadilhagem;
c) Processamento e análise de dados de fotoarmadilhagem para estimar abundância de hospedeiros domésticos e selvagens;
d) Cultura bacteriológica para isolamento de MTC em laboratório BSL3;
e) PCR convencional e em tempo real para ácidos nucleicos de MTC;
f) Análises epidemiológicas com métodos Bayesianos;
g) Interação com stakeholders para transferência de conhecimento;
h) Colaboração na redação de relatórios técnicos e publicações científicas.

5. Remuneração
Remuneração mensal: €2.351,53 (nível 33), conforme tabela da FCT. Pagamento por transferência bancária mensal. Inclui seguro de acidentes pessoais. Legislação aplicável: Código do Trabalho, aprovado pela Lei n.º 7/2009, de 12 de fevereiro, na redação atual (incluindo alterações até 2025).

6. Local de trabalho
CIBIO – Centro de Investigação em Biodiversidade e Recursos Genéticos, Universidade do Porto, Rua Padre Armando Quintas nº7, 4485-661 Vairão, Portugal, com períodos de trabalho de campo em Portugal e Espanha e possíveis estadias em instituições parceiras.

7. Formalização da candidatura
Prazo: 24/11/2025 a 12/12/2025
Submissão: https://www.cibio.up.pt/en/jobs

Documentos:
i) Curriculum vitae (máx. 4 páginas A4);
ii) Certificado de habilitações;
iii) Comprovativo de autorização de residência (se aplicável). Data prevista de início: 01/01/2026.

8. Critérios de seleção
i) Relevância da experiência prévia em epidemiologia (50%);
ii) Relevância da experiência em análise de dados (20%);
iii) Qualidade global do CV (30%). 

Classificação final: escala 0-100.

O júri pode convocar entrevista (presencial ou videoconferência) se a diferença entre os doisprimeiros candidatos for inferior a 10 pontos. O júri pode não atribuir a posição se nenhum candidato cumprir os requisitos.

9. Júri
Presidente: Nuno Santos (Investigador Auxiliar, BIOPOLIS-CIBIO)
Vogais: Gonçalo Curveira Santos, Tereza Almeida
Suplentes: Paulo Célio Alves, João Queirós

10. Resultados
Todos os candidatos serão inforados por e-mail. Após notificação, têm 10 dias para apresentar reclamação via hru@biopolis.pt. Candidaturas incompletas ou que não cumpram requisitos serão excluídas. Declarações falsas serão penalizadas por lei.

11. Política de não discriminação e igualdade de acesso
A Associação BIOPOLIS promove ativamente a igualdade de oportunidades, garantindo que nenhum candidato é privilegiado ou prejudicado com base em ascendência, idade, sexo, orientação sexual, estado civil, situação familiar ou económica, educação, origem social ou económica, património genético, incapacidade, doença crónica, nacionalidade, origem étnica ou raça, local de nascimento, língua, religião, convicções políticas ou ideológicas, ou filiação sindical. Nos termos da Lei n.º 4/2019, de 10 de janeiro, na redação atual, os candidatos devem declarar, sob compromisso de honra, o grau e tipo de deficiência, bem como necessidades específicas de comunicação ou interação durante o processo de seleção.