Job: Contract for a PhD holder

Reference: BIOPOLIS2025-19

Main research field: Biological Sciences/Archaeogenetics

Associação Biopolis is calling for applications for a Junior Researcher position (Reference BIOPOLIS 2025-19) within the scope of the ARIES project (https://doi.org/10.54499/2022.04843.PTDC) funded by FCT - Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., at CIBIO/Associação BIOPOLIS, through a non-fixed term contract for an expect duration of nine months, focused on archaeogenetic analyses of domestic sheep from the Iberian Peninsula and North Africa.

 

Applicable Legislation: Applicable Legislation: Decree-Law no. 57/2016 of August 29th, amended by Law 57/2017 and Regulatory Decree No. 11- A / 2017 which approved the doctorate hiring regime destined to stimulate scientific and technological employment for all knowledge areas (RJEC); Portuguese Labour Code, approved by Law 7/2009 of February 12, in its actual form.

 

Jury composition: The Jury will be chaired by Prof. Catarina Ginja (CIBIO and FMV, ULisboa), having as effective members Prof. Ana Elisabete Pires (CIBIO and Universidade Lusófona) and Prof. Cleia Detry (UNIARQ, ULisboa), and substitute member Prof. Nelson Almeida (Universidade de Évora).

 

Workplace: The work will be carried out at the CIBIO-InBIO, in Vairão, Vila do Conde.

 

Monthly remuneration: Monthly remuneration to be paid is the one set by article 23 (3) of RJEC, corresponding to level 33 of the Single Salary Table, approved by Order no. 1553-C/2008 of December 31st, i.e. 2.351,53 Euros.

 

Admission requirements: Application can be submitted by any national, foreign and stateless candidate(s) holding a doctorate degree in Biology, Genetics, Animal Science or related fields compatible with the work plan. In case the doctorate degree was awarded by a foreign higher education institution, it must comply with the provisions of Decree-Law no. 341/2007 of October 12th, and all formalities established therein must be complied with at the signature of work contract.

 

We seek candidates with (i) experience in ancient DNA methodologies (or in the genetic analysis of degraded specimens), such as laboratory skills in ancient DNA extraction from animal specimens and preparation of ancient DNA libraries for next-generation sequencing; (ii) experience in bioinformatics analysis of next-generation sequencing of ancient and modern specimens and whole-genome genotyping data; (iii) expertise in Population Genomics and Genome Wide Association Studies; (iv) excellent communication skills in English (verbal and written); (vi) experience in participating in international research projects; (vii) experience in publishing research papers in peer-reviewed journals (viii) solid work ethics and good teamwork skills and finally; (ix) driver’s license valid in Europe at the time of the start of the project and availability to travel and work independently outside regular working hours (weekends and holidays).

 

Working plan: Within the scope of the project, the following tasks will be developed: (i) sampling of archaeological sheep specimens for ancient DNA analysis in collaboration with zooarchaeologists;(ii) extracting DNA from archaeological specimens (i.e. bones and teeth) and preparing genomic libraries for next-generation shotgun and targeted sequencing, in dedicated facilities offered by foreign partners (e.g. Trinity College Dublin); (iv) integrative statistical analysis of genomic and zooarchaeological data using cutting-edge methodologies to estimate genetic diversity, infer population structure, phylochronologial relationships and modes of improvement of Iberian and North African sheep; (v) preparing manuscripts for publication; (vi) organizing informal meetings among project partners; (vii) presenting the project results in national and international scientific meetings.  

 

 

 

The assessment criteria are:

The evaluation of the CV of the candidates, in particular the scientific merit and research experience will take into consideration the elements presented falling within the scope of the specific areas of the tender (see admission requirements) and will be performed according to the following criteria:

 

1. Integrated assessment of the curriculum trajectory of the candidate, based on an overview of their scientific merits, namely:

I. Overall scientific coherence of the CV – 20%;

II. Diversity and quality of scientific indicators, including relevant published peer-reviewed articles and abstracts in the specific areas of the announcement (see admission requirements) – 25%;

III. Participation in international research projects – 5%.

 

2. Relevant experience, proved in CV, in:

i) experience in archaeogenomics laboratory analyses – 15%

(ii) experience in bioinformatic analyses of next-generation sequencing of ancient and modern data – 20%

(iii) experience in Population Genomics and Genome-Wide Association Studies – 15%

 

Candidate final classification system shall be given based on a scale 0 to 100.

 

The panel shall deliberate by means of roll-call vote justified under adopted and disclosed selection criteria,

with no abstentions allowed.

 

Minutes of panel meetings shall be executed and include a summary of all occurrences of said meeting, as well

as of all votes casted by the members and respective reasoning, and shall be provided to candidates whenever

required.

 

Once the selection criteria have been applied, the selection board draws up an ordered list of successful candidates with their respective ranking.

 

Panel’s final decision shall be validated by the leader of the institution, who is also in charge of deciding about

the hiring.

 

Publicity and communication of results: all candidates will be informed by email about the result of their application.

 

Application formalization:

17.1. The applications are formalized at the electronic address https://www.cibio.up.pt/en/jobs/ with following documents in a digital form, in PDF format:

 

i) Curriculum vitae

ii) Qualifications Certificate

iv) Other relevant documentation

 

Application: The call for applications is open between 21/04/2025 a 06/05/2025

 

The contract is expected to start on the 1^st of June 2025.

 

All candidates who formalize their applications in an improper way or fail to prove the requirements imposed by this tender are excluded from admission. In case of doubt, the panel is entitled to request any candidate to present further documentation supporting their statements.

 

False statements provided by the candidates shall be punished by law.

 

Both admitted and excluded candidate list and final classification list shall be notified by email.

 

Final Decision Deadline: After notification, all candidates have 10 working days to comment through the email hru@biopolis.pt. Panel’s final decisions are pronounced within a period of 90 working days, from response period deadline.

 

This tender is exclusively destined to fill this specific position and can be terminated at any time until approval of final candidate list, expiring with the respective occupation of said position.

 

Non-discrimination and equal access policy: Associação BIOPOLIS actively promotes a non-discrimination and equal access policy, wherefore no candidate can be privileged, benefited, impaired or deprived of any rights whatsoever, or be exempt of any duties based on their ancestry, age, sex, sexual preference, marital status, family and economic conditions, instruction, origin or social conditions, genetic heritage, reduced work capacity, disability, chronic illness, nationality, ethnic origin or race, origin territory, language, religion, political or ideological convictions and union membership.

 

In order to comply with Law no. 4/2019, of 10 January, candidates must declare on the application form, under a statement of honor, their degree of disability, the type of disability and the means of communication/expression to be used in the selection process.

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Posição: Investigador Júnior

Referência: BIOPOLIS 2025-19

Área científica: Ciências Biológicas/Arqueogenética

 

 

A Associação Biopolis abre concurso para uma posição de Investigador Júnior (Referência BIOPOLIS 2025-19) no âmbito do projeto ARIES (https://doi.org/10.54499/2022.04843.PTDC) financiado pela FCT – Fundação para a Ciência e a Tecnologia, I.P., no CIBIO/Associação BIOPOLIS, por via de um contrato a termo incerto com uma duração prevista de 9 meses para desenvolver trabalho focado em análises arqueogenéticas de ovelhas domésticas da Península Ibérica e do Norte de África.

 

Legislação e regulamentação aplicável: Decreto-lei n.º 57/2016, de 29 de agosto, alterado pela Lei 57/2017 e Decreto Regulamentar n.º 11-A/2017, que aprova um regime de contratação de doutorados, destinado a estimular o emprego científico e tecnológico em todas as áreas do conhecimento (Regime Jurídico do Emprego Cientifico - RJEC); Código do Trabalho, aprovado pela Lei n.º 7/2009, de 12 de Fevereiro, na sua redação atual.

 

Composição do júri de seleção: nos termos do artº 13 do RJEC o júri será presidido pela Prof. Catarina Ginja (CIBIO e FMV, ULisboa), tendo como vogais efetivos a Prof. Ana Elisabete Pires (CIBIO e Universidade Lusófona) e a Prof. Cleia Detry (UNIARQ, ULisboa), e como vogal suplente o Prof. Nelson Almeida (Universidade de Évora).

 

Local de trabalho: O trabalho será desenvolvido no pólo do CIBIO-InBIO de Vairão, Vila do Conde.

 

Valor da remuneração mensal: A remuneração mensal a atribuir é a prevista na alínea a) no n.º 1 do artigo 15.º do RJEC, e artº 2 do Decreto Regulamentar nº 11-A/2017, de 29 de dezembro correspondente ao nível 33 da Tabela Remuneratória Única, aprovada pela Portaria n.º 1553-C/2008, 31 de dezembro, sendo de 2.351,53 Euros.

 

Requisitos de admissão: Ao concurso podem ser opositores (as) candidatos (as) nacionais, estrangeiros (as) e apátridas que sejam titulares do grau de doutor(a) em Biologia, Genética, Ciência Animal ou área científica afim e detentores (as) de um currículo científico e profissional que revele um perfil adequado à atividade a desenvolver.

Caso o doutoramento tenha sido conferido por instituição de ensino superior estrangeira, o mesmo tem de obedecer ao disposto no Decreto-Lei n.º 66/2018, de 16 de Agosto, devendo quaisquer formalidades aí estabelecidas estar cumpridas até à data da assinatura do contrato de trabalho.

 

Requisitos específicos:

Procuramos candidatos com (i) experiência de trabalho em metodologias de ADN antigo (ou na análise genética de espécimes degradados), tais como competências laboratoriais em extração de ADN antigo de espécimes animais e preparação de bibliotecas de ADN antigo para sequenciação de última geração (NGS); (ii) experiência em análise bioinformática de dados de NGS da ADN antigo e moderno, e de genotipagem de marcadores genómicos (e.g. SNP arrays); (iii) experiência em análises de Genómica Populacional e Estudos de Associação Genómica; (iv) excelentes capacidades de comunicação em inglês (verbal e escrita); vi) experiência na participação em projectos de investigação internacionais; vii) experiência na publicação de artigos de investigação em revistas especializadas com revisão por pares; viii) valores de ética de trabalho e boas capacidades de trabalho em equipa; ix) carta de condução válida na Europa no momento do início do projeto e disponibilidade para viajar e trabalhar de forma independente fora do horário normal de trabalho (fins-de-semana e feriados).

 

Plano de trabalhos: No âmbito do projecto, serão desenvolvidas as seguintes tarefas: (i) amostragem de espécimes arqueológicos de ovelhas para análise de ADN antigo em colaboração com zooarqueólogos; (ii) extração de ADN de espécimes arqueológicos (i.e. ossos e dentes) e preparação de bibliotecas genómicas para sequenciação de última geração, em instalações dedicadas exclusivamente a análises de arqueogenética de parceiros estrangeiros (e.g. Trinity College Dublin); (iv) análise estatística integrada dos dados genómicos e zooarqueológicos utilizando metodologias inovadoras para estimar a diversidade genética, inferir a estrutura populacional, as relações filocronológicas e os modos de melhoramento dos ovinos Ibéricos e do Norte de África; (v) preparação de manuscritos para publicação; (vi) organização de reuniões informais entre os parceiros do projeto; (vii) apresentação dos resultados do projeto em reuniões científicas nacionais e internacionais.

 

Nos termos do artigo 5.º do RJEC a seleção realiza-se através da avaliação do percurso científico e curricular dos candidatos.

 

São critérios de avaliação:

Na avaliação do CV dos candidatos, em particular da experiência científica e do mérito científico, serão valorizados os elementos apresentados pelas áreas específicas do concurso de acordo com os seguintes critérios:

 

1. Avaliação integrada da trajectória curricular do candidato, com base numa visão geral do seu mérito científico:

I. Coerência científica global do CV - 20%

II. Diversidade e qualidade dos indicadores científicos no âmbito da área de investigação (ver requisitos de admissão) - 25%

III. Participação em projectos de investigação internacionais- 5%

 

2. Experiência relevante, demonstrada em CV, em:

I. experiência em trabalho laboratorial em arqueogenómica – 15%

II. experiência em análise bioinformática de dados de sequenciação genómica de última geração de ADN antigo e moderno – 20%

III. experiência em análises de Genómica Populacional e Estudos de Associação Genómica – 15%

 

O sistema de classificação final dos candidatos é expresso numa escala de 0 a 100.

 

O júri delibera através de votação nominal fundamentada de acordo com os critérios de seleção adotados e divulgados, não sendo permitidas abstenções.

 

Das reuniões do júri são lavradas actas, que contêm um resumo do que nelas houver ocorrido, bem como os votos emitidos por cada um dos membros e respetiva fundamentação, sendo facultadas aos candidatos sempre que solicitadas.

 

Após conclusão da aplicação dos critérios de seleção, o júri procede à elaboração da lista ordenada dos candidatos aprovados com a respetiva classificação.

 

A deliberação final do júri é homologada pelo dirigente máximo da instituição a quem compete também decidir da contratação.

 

Formalização das candidaturas:

 

18.1 As candidaturas são formalizadas mediante requerimento submetido no endereço eletrónico https://www.cibio.up.pt/en/jobs/, com os seguintes documentos em suporte digital, de preferência em formato de PDF:

i) Curriculum vitae;

ii) Certificado de habilitações

iii) outros documentos que considere relevantes

 

Período de apresentação de candidaturas decorre entre 21/04/2025 a 06/05/2025

 

A data prevista de início do contrato é 1 de Junho de 2025.

 

São excluídos da admissão ao concurso os candidatos que formalizem incorretamente a sua candidatura ou que não comprovem os requisitos exigidos no presente concurso. Assiste ao júri a faculdade de exigir a qualquer candidato, em caso de dúvida, a apresentação de documentos comprovativos das suas declarações.

 

As falsas declarações prestadas pelos candidatos serão punidas nos termos da lei.

 

Os candidatos admitidos e excluídos serão notificados por correio eletrónico com recibo de entrega da notificação.

 

Prazo de Reclamação e Decisão Final: Após a notificação, todos os candidatos dispõem de 10 dias

úteis para apresentar reclamação através do email hru@biopolis.pt. As decisões finais do júri são proferidas no prazo de 90 dias úteis, a

contar do termo do prazo de resposta.

 

O presente concurso destina-se exclusivamente ao preenchimento do posto de trabalho indicado e

pode ser extinto a todo o tempo até à homologação da lista final de candidatos, caducando com a

respetiva ocupação do referido posto de trabalho

 

Política de não discriminação e de igualdade de acesso: A Associação BIOPOLIS, promove ativamente uma política de não discriminação e de igualdade de acesso, pelo que nenhum candidato/a pode ser privilegiado/a, beneficiado/a, prejudicado/a ou privado/a de qualquer direito ou isento/a de qualquer dever em razão, nomeadamente, de ascendência, idade, sexo, orientação sexual, estado civil, situação familiar, situação económica, instrução, origem ou condição social, património genético, capacidade de trabalho reduzida, deficiência, doença crónica, nacionalidade, origem étnica ou raça, território de origem, língua, religião, convicções políticas ou ideológicas e filiação sindical.

 

Por forma a dar cumprimento à Lei n.º 4/2019, de 10 de janeiro os candidatos devem declarar no formulário de candidatura, sob compromisso de honra, o respetivo grau de incapacidade, o tipo de deficiência e os meios de comunicação/expressão a utilizar no processo de seleção.